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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性鱼类特女性朋友、寡核苷酸淡化料工费高额或控制流程图复杂性。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教学团队图片在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个节省成本预算、跨植物物种、全网络平台兼容的全新解决方案。

杂志筒介

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国家有效院基因基因与生长发育动物学探究所和国家基因基因懂得主办人的国际上科研杂志杂志,强院于报道范文灵魂有效和医疗基因基因学教育邻域的爱独特性探究结果。JGG 202历经四年度关系因素7.1,Scopus科研杂志杂志测评的指标CiteScore 9.9,位居JCR 202历经四年度GENETICS & HEREDITY教育邻域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY教育邻域Q1区,位居国家有效院杂志杂志系统盘动物学种类别1区(Top杂志杂志),基因基因学和血生化与原子动物学小类双1区。

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哪些是HEATag

巧设的“二融合”设计的

HEATag是由凝集素和HUH内切酶产生的要融合淀粉酶

「导航定位器」模块图片 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化表达(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「无线联接器」控制器 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)字段方形码来进行共价相连。

“1+1>2”的成效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行子样本图标与产品追溯。

Fig1: HEATag多方面标记图片作用提示图

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实际战斗考验

HEATag到达 有大多能打?

还可以在各种生活条件下,体现母乳喂奶食草动物神经細胞系单神经細胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。深入分析的团队为 HEATag 设计了多轮 “心理测试仪”,从组织系到组织核,从高温到高温,从新鲜样表到固定的样表,全位置安全验证它的稳定的性和靠谱性。

首要轮测式对应母乳喂养各种动物癌细胞系系系:科研人员管理抉择了源自人、鼠、仓鼠这几个鱼类的七种癌细胞系系(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下要 HEATag 标记符号后结合测序。然后二手回收的 11447 个癌细胞系系中,85.66% 都能经过 HEATag 长形码精确性匹配好到原鱼类,样板间交叉重合空气污染特少,UMAP 聚类算法分析一下也真接事实证明,HEATag 长形码与鱼类特情人遗传基因组特征英文极高一致性。 完了,测评经济因素进每一步优化:调查员工战胜困难在 4℃下标志新的内部、在在常温下标志甲醇规定内部,甚至会会直接标志内部核。最终一如既往亮眼睛:全部经济因素下,样板价格标签与鱼类信息均具备有不错的关于性,拆成精准的率超 95%。然而甲醇规定会引致中度的转录本交叉性污染问题,内部核配制会小量 RNA 掉失,内部类型、的注音最终一如既往与新的样板稳定保持一致,声明书 HEATag 能否标志有所差异治理 经济因素下的实验英文样板。

Fig2: HEATag 可在各不相同水平下进行单细胞核转录组混样了解

能够箭头哺乳期两栖生物和海洋环境无脊椎骨两栖生物的原代细胞膜

假如说人体神经细胞系测试软件是 “基本知识题”,那企业样例就是说 “增加题”, 这样的样例都因人体神经细胞型错综复杂、工作环境认知性特色,变成了标注能力的 “突破点”,而 HEATag 正好在这样的 “突破点” 上出现了长处。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织化,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅仅能被更准确划分,大部分通常细胞系类型、的聚类算法报告都精准可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋环境海洋生物的匹配性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长条码与动物群转录组兼有较高不对性,找不到显示因高盐的环境促使的 “图标已过期”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可构建喂奶動物组织开展样本量许多 scRNA-seq 具体分析

Fig4: HEATag可完成新鲜松茸深海无脊梁骨宠物各种方面 scRNA-seq 研究分析

HEATag与血细胞的紧密联系不影响转录组的为显著改动

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在搞定标识工作的的同时,不用对之后的的转录混合物析有干挠,有保障了钻研资料的逼真性。

Fig5: HEATag不想导致样板的 RNA 传达方式

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未来发展可期

HEATag 能为单细胞系科研引来哪个?

HEATag 的附加值,远不是于 “消除标出原因”,它的灵巧性和普遍性,时未为单组织细胞研究方案打开网页非常多有概率较高

从APP场地去看

HEATag 能所覆盖从 “很简单相对剖析”(如癌聚集与一切正常聚集、药物治疗处里与参考)到 “大投资额探索”(如聚集人体血细胞图谱生成、mtk量挑选)的全标准具体需求。现在 PIP-seq、Stereo-cell 等一种新型可拓展技术设备的趋势,HEATag 还能进1步上升单人体血细胞探索的通量,助推研发开发团队开展调研更广投资额的工程项目。

从跨范围空间一起来看

HEATag 既可代替于转录组学,还能与表观人类基因组学、球脂肪酸组学、位置组学等高技术工艺根据,凭借定制化引索和寡核苷酸字段,HEATag 就还能更快容入有所差异的组学工作流程,不引响数字信号捕捉到角度。直接,依托于HEATag还就还能快速发展单受损细胞糖组学探索高技术工艺。

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协议动态图片

拜谱微生物与陈凯硕士生导师制定基本合作的意向但这并

直得观注的是,在 HEATag 技術彰显出比较大广泛运用前景的蓝本下,拜谱深海怪物已与北方深海学科与公程广东省进行标本室(长沙 )陈凯副教授获得最初始加盟的想法。交易双方彼此计划表围绕着 HEATag 技術的加工业化实施、科技创新上班流量转化等导向发展宽度协同合作,推向该低代价、跨种群的单神经元标记图片技術更快广泛运用于事实科技创新上班景象,为更好进行标本室展示 高效率的、金钱的单神经元论述交通工具,保驾护航科技创新上班上班者在神经元深海怪物学、深海深海怪物学、症状考核机制等范围选取更好突破点
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