
2024年9月由沈阳种植业大学时张万刚讲师公司在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物技术为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文字幕版头:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2025年后果分子:5.7
发过时段:2024年9月
买家企事业单位:南京农业大学
设计资料:蛋白
拜谱提高技术性:亚硝基化修饰组学
方法途径:
一、学习结论
01.Caspase-3活性氧
现有尚不看不清楚NO对caspase-3的治理和改善使用有没归因于NO介导的S-亚硝基化,多种溶液浓度系数的GSNO用于外源性NO生产,以诱惑caspase-3的身体之外S-亚硝基化。然而意味着,与没了GSNO的组不同之处,100、200和400μM GSNO组的caspase-3活力性相关系数降底(图1),与仍然新闻稿不对。GSNO处理降底caspase-3活力性的潜在性的原因仍进一步展现。
图1 各个溶液浓度的GSNO处里对caspase-3亲水性的决定
02.Caspase-3的S-亚硝基化情况
探析Caspase-3的亚硝基化水平,以展现GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO外理后,探测到caspase-3蛋清S-亚硝基化力度加大(图2)。这个后果表达,外源性GSNO培训可取得成功促进caspase-3的离体S-亚硝基化。引人特别的是,在没了GSNO长期存在的比对组中探测到两个暗淡的S-亚硝基化带,这表达caspase-3或许再次发生内源性的S-亚硝基化。还有就是,本探析中caspase-3的S-亚硝基化水平较高,而caspase-3的活性氧影响,这与事先的探析不一。那么,caspase-3的活性聊天S-亚硝基化遮盖位点尚不看不清楚,还需求进1步的宇宙探索。
图2 GSNO治理 对caspase-3S-亚硝基化水准的印象
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化装饰组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。黄色标签的字段带表S-亚硝基化肽,红颜色标签的C带表S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结蛋白酶
结蛋清算作是一种比较根本的血人体细胞骨架蛋清,在能维持肌血人体细胞构成的构成完善性和缩紧性的方面起着比较根本功能,科学研究S-亚硝基化caspase-3对结蛋清溶解的敏感度性都含有比较根本积极意义。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的刚开始肌化学玻纤蛋清)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原化学玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的完善结蛋清含铁有效缩减,表示caspase-3对结蛋清都含有内在的的蛋清水解反应专业能力。在GSNO孵育后,完善结蛋清的含铁突出曾加(P < 0.05)。还有就是,当GSNO渗透压增大时,完善结蛋清的含铁持续保持上涨(P < 0.05)(图5)。某种找到得出结论,SNO绘制的caspase-3以的水平依赖于的方试促使结蛋清的溶解。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙蛋白质-T
肌钙核球淀粉酶-T (TnT)是原肌球核球淀粉酶调试主管肌群收宿的细细的的必要肌原化学食物化学纤维核球淀粉酶。TnT的分解特点是测试到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化必要条件下,caspase-3对TnT的分解时候图甲6提示,与Std组(不包括caspase-3和GSNO的肌原化学食物化学纤维)相信,caspase-3组中30 kDa TnT场面相关系数上升,揭示caspase-3参入了TnT的分解,不但,caspase-3与GSNO的孵育以至于30 kDa TnT走低。在100和200 μM GSNO组互相无测试到凸显的异同(P > 0.05),而当GSNO的溶度达到400 μM 时,该场面相关系数减小(P < 0.05)。这么多认为揭示了SNO遮盖的caspase-3对TnT分解的治理和改善功效。结核球淀粉酶和TnT是caspase-3的刺激性底物,而GSNO补救较低caspase-3的生物将以至于肌原化学食物化学纤维核球淀粉酶分解水平较低。所写所写,NO帮助的S-亚硝基化能否用遮盖半胱氨酸残基来调试caspase-3的生物,因而进两步危害其对结核球淀粉酶和TnT的核球淀粉酶油脂水解专业能力,最后危害牛羊肉品质质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3分解肌钙球蛋白-T
二、个人心得体会
本深入分析旨在通过研究S-亚硝基化对caspase-3表达的决定力和其之后对牛羊肉肌原钎维体内生物降解的决定力。核核核蛋白S-亚硝基化也可以表达caspase-3的半胱氨酸残基,得以从而导致caspase-3抗逆性大幅度降低,进一大步能够抑制了其对牛羊肉肌原钎维核核核蛋白的核核核蛋白蛋白质水解效果。三、拜谱个人心得体会
探索主要包括了酶活测试,亚硝基化呈现组学讲解,WB等的检测体系,出现 核球蛋白质含量质S-亚硝基化是可以呈现caspase-3的半胱氨酸残基,这诱发了caspase-3亲水性的降底,并举两步压制了其对牛肉片肌原钎维核球蛋白质含量质的核球蛋白质含量质电离技能。本探索为解说核球蛋白质含量质质亚硝基化对口感的控制体系可以提供好几个个新的上帝视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球氨基酸组学、掩盖球氨基酸组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号品牌,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total氧化物呈现、氧化钙含量巯基,欢迎大家咨询!
参考资料文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663