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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核生态学mRNA中最沉要的转录后掩盖,在真核生态学的病检和生理问题时中起着至关很重要的用途。心脏病群体行为心理障碍有的是种不可逆转的神经操作系统中枢神经操作系统操作系统退行性疾患,目前为止成长事实上切系统尚末全部揭示,和或缺很好的防护和诊治科技手段。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物学为其提供m6A甲基化进行分析技术应用保障,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

好文章明称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

投资者计量单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

调查材料:小鼠脑组织

拜谱带来了技术设备:m6A甲基化(MeRIP-seq)

文献综述图:

图1| 文献综述图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

设计结杲

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因体现的变换

定量分析相关人群一开始开发了高脂食品和认知能力缺陷(DCI)的小鼠建模。为对比对比组(n = 3)和DCI组(n = 3)当中的m6A染色体呈现,定量分析相关人群用到MeRIP-seq做了转录组范围内内的m6A-seq定量分析。在DCI组的10664个编号规则染色体转录物(mRNAs)共产党找到对比组的23715-7个不重偏移叠的m6A峰。相对来说之侧,DCI组具体表现出23,755-7个非重偏移叠m6A峰。这里面,9345-7个甲基化染色体在对比组和DCI组当中重偏移叠(图2)。

图2| 对应组和DCl组m6a表达什么是基因的维恩图

共检测出1274个的差异甲基化的m6A位点(DMMSs),在这其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化平行分辨有明显优于照表组。讲解其规划情形会发现m6A峰规划在整体RNA中(图3A),并会根据其规划的转录部分分以內五组:5'UTR、3'UTR、转录始点位点部分场面描写、解除解锁账号密码锁子场面描写、始点解锁账号密码锁子场面描写和数字字段(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和解除解锁账号密码锁子付进有明显聚集(图3B)。成了监测以上着色体上m6A突显的部分,设计人淘汰了有峰引用的部分,并测试了以上着色体上reads的合并率。在DCI组中,m6A突显区喜爱于3'UTR区(图3C)。大部分mRNA内的DMMS都被位置定位到着色体上前监测其规划简介。有差异小鼠着色体的m6A突显谱有差异。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的转换

为了更好地验测m6A装饰在DCI小鼠中的怪物学性能,理论研究师从几组选定择含有DMMS的血清质商品代码什么是染色体采取GO和KEGG具体进行研究分享(图4A)。在GO具体进行研究分享中,高甲基化什么是染色体在体生殖癌细胞核期间、怪物期间调节作用、促使活力性和杂环单质构建起来中连接系数含有。KEGG通道具体进行研究分享信息显视,高甲基化什么是染色体与T体生殖癌细胞核肾上腺素肾上腺素受体数据通道、小体生殖癌细胞核肺癌患者和RIG-I样肾上腺素肾上腺素受体数据通道连接(图4B)。就低甲基化什么是染色体,GO具体进行研究分享信息显视在体生殖癌细胞核期间、分解代谢期间和构建起来期间中连接系数含有有机质环单质、构建起来杂环单质和促使活力性(图4C)。KEGG通道具体进行研究分享体现了低甲基化什么是染色体与肥厚性心肌病和Hippo数据通道的连接(图4D)。

图4| 差异性甲基化m6A位点的环路含有

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据显示的合作进行分析

随即研究方案的人员将m6A MeRIP-Seq的信息和已经RNA-Seq的信息做合作深入分析,发觉163个mRNA,m6A峰和mRNA技术更为明显变。41种mRNA的m6A和mRNA技术调涨,14种mRNA技术调整。因此,30个dnamRNA理解调涨,m6A技术调整,7八个dnamRNA理解调整,m6A技术调涨(图5A)。后,实现了个PPI无线网络来彰显163个dna商品编码的球蛋白范围内的拼接(图5B)。

如同6如图是,GO和KEGG解析涵盖四组:(1) m6A上涨,mRNA上涨;(2) m6A上涨,mRNA上涨;(3) m6A上涨,mRNA上涨;(4) 人类表观遗传m6A上涨和mRNA上涨。在GO解析中,m6A上涨和mRNA上涨的人类表观遗传在上皮生殖内部消化吸收期间、清香族类化合物生物技术合并期间和RNA消化吸收期间的干预中偏态丰度。KEGG解析体现 ,这部分人类表观遗传在脂肪堆积含量酸消化吸收、小上皮生殖内部肺癌患者、丙酸消化吸收和甲苯酸消化吸收中丰度。对于那些m6A上涨和mRNA上涨的人类表观遗传,GO解析体现 在亚铁紧密相结合起来、亚胺丙氨酸脱羧酶化学活化、天冬氨酸1-脱羧酶化学活化和上皮生殖内部联系拼装负干预中丰度;KEGG解析体现 在2型痛风、脂肪堆积含量上皮生殖内部分子表现环路和胰岛素表现环路中丰度。在GO解析中,m6A上涨和mRNA上涨的人类表观遗传在寡肽紧密相结合起来、谷胱甘肽紧密相结合起来和二硫硫化物硫化修复酶化学活化中丰度,而在KEGG解析中,这些在柠檬汁酸嵌套重复(TCA嵌套重复)、丙酸消化吸收和多种类凋亡中丰度。在GO解析中,m6A上涨和mRNA上涨的人类表观遗传在胚胎骨膝盖骨状态再次发生、蛋白质激酶化学活化激话和NADP消化吸收期间中丰度,在KEGG解析中,m6A上涨和mRNA上涨人类表观遗传在新霉素、卡那霉素和感觉神经美味分子表现环路中丰度。

图5| m6A甲基化与mRNA呈现的联合技术分析一下

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG深入分析

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本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物技术提供了m6A甲基化技能服务于,拜谱生物制品可提供完善成熟的淀粉酶组学、基础代谢组学、转录组学并且 两组学聯合类产品技术设备服务管理,欢迎致电咨询!

参照论文:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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