草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿整体最经常见到的直肠疾病的一个。肾组建中CaOx晶胞过饱和点积累会引起肾小管人体细胞影响和凋亡，最后引起肾结石的组成。短链皮下皮下脂肪酸由直肠内活性污泥法疾病厌氧发酵营养健康食物纤维生产，不在产品局部直肠防御系统中激发出来帮助，另外在整体横向上也激发出来关键性帮助。中间，丁酸是最充足的短链皮下皮下脂肪酸，含有免疫检测压制和免疫检测压制帮助,本调查浅论丁酸对CaOx肾结石的帮助及潜在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院科室泌尿内科吴忠专家、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生态学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了数据网络药剂学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

原创文章名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 的客户单位名称：华山医阮 分析客体：大鼠、HK-2细胞膜 好友分组相关信息：对比组（Con）、建模方法组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来技巧：网络数据药学学论文检测

构思步骤图

的研究结杲

科学研究方案成员先是融合大鼠实体对模型工具，能够 生理性什么是生化目标和组织结构病理学学固色等科学研究方案的方法得知丁酸就可以以减少CaOx实体对模型工具大鼠肾CaOx硫化锌的养成和挫裂伤，缓和CaOx实体对模型工具大鼠的支原体感染挫裂伤和腐蚀产品的太过表达出。另外，丁酸还可克制草酸引导的HK-2上皮上皮细胞挫裂伤、腐蚀应激状态和上皮上皮细胞凋亡。 为洞察剖析一下丁酸型式的和靶DNA无线网站，调查人从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和三维图型式的（图1A）。开始PharmMapper统计资料库和Uniprot统计资料库整理后共需求出11八个丁酸靶DNA供进一歩剖析。将DNA文件列表接入STRING统计资料库，开始PPI无线网站剖析。Cytoscape拿到了顺序的前20的联络线靶DNA的详细数据分析无线网站图，还有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。一些联络线DNA与无线网站中的相关内容联DNA均体现出一定的的相关内容联性，阐明一些DNA或者引领着融合的功效。GO和KEGG剖析证明了丁酸联络线DNA的相关内容联经过和微植物学模块（图1C）。联络线DNA通常与类固醇性肾上腺素回应、空气被氧化应激状态状态回应、渗透性氧上皮细胞对类固醇性肾上腺素刺激性的功效或对含酸性电化学化合物的功效密切相关。结合以上证明，一些联络线DNA通常参与者了空气被氧化应激状态状态和对渗透性氧的微生物工程功效期间，是肾结石进行考核机制中至关决定性的经过，这证明丁酸或者在肾结石中引领决定性的功效。

图1| 丁酸构成与靶人类基因线上分享(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部思考丁酸对CaOx肾结石确实切靶什么是表观遗传组，探索方案职工利用GEOdb2数据库信息库对GSE73680中的健康对应与CaOx肾结石患病者的什么是表观遗传组性别差异实行了探索方案。对应组与CaOx结石患病者的不错性性别差异体现爱什么是表观遗传组（DEGs）肿瘤筛查规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个什么是表观遗传组发现不错转化，进来3379个（89.4%）什么是表观遗传组体现爱上浮，404个（10.6%）什么是表观遗传组体现爱变动（图2A）。对DEGs实行聚类分析法算法概述，热图显视了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析法算法特殊性（图2B）。最后，探索方案职工利用GeneCardsdb2数据库信息库手动判定了370个会与CaOx肾结石各种想关的什么是表观遗传组，名次前20位的估计什么是表观遗传组以及其各种想关性计分下图2C所显示。为了更好地找回丁酸调理CaOx肾结石的核心靶点，探索方案职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石各种想关什么是表观遗传组工作能够得到了个Venn图。决定性，CYP2C9被决定为丁酸印象CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。还有就是，探索方案职工还实行了丁酸与CYP2C9的原子核连接，CYP2C9的3个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动角色，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采用网络信息临床药理学分析CYP2C9是丁酸干扰CaOx肾结石的靶基因遗传后，学习工人还用細胞科学试验印证了CYP2C9可大幅度降低草酸成脂的HK-2細胞的ROS能力、炎症病变受伤和凋亡。

图2| 而言据库协同了解估计CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶什么是基因

的研究结果显示

本科研首选看到丁酸在休外和肚子里均能可以减缓CaOx肾结石建模的被被氧化应激性性和真菌感染损害，随着用网格药学学学淘汰得见丁酸危害CaOx肾结石的不确定靶点——CYP2C9，结果用細胞系实验操作灵魂存在CYP2C9在草酸盐诱发的HK-2細胞系ROS总体水平、真菌感染损害和凋亡。这一项些看到发现丁酸可以用可以减缓CYP2C9来可以减缓CaOx肾结石的被被氧化应激性性，解决真菌感染损害。这一项时候中拜谱微动物提供了了网格药学学学科技贴心的服务，于此拜谱微动物可从而提高发育成熟健全完善的基因遗传组学、蛋白酶质组学、消化吸收组学等两组学软件及科技贴心的服务，喜爱垂询咨询了解。！ 考虑文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.