
近日,南京市医科高中弟一复属医院医生王学浩院土团队图片在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向疗法能量场基础代谢检测分析服务。
英文翻译名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名文章标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
玩家单位名称:南京医科大学
探索村料:细胞
拜谱提供了服务项目:转录组测序+蛋清互作组+靶向药物热量基础代谢组
系统行车路线:
钻研然而
01、YBX1被评定为HCC中糖酵解的关键所在遗传基因
本理论研究收集HCC良性癌肿样本量(n=7)的单血细胞核膜RNA测序数据资料源集采取介绍,看到糖酵解活性酶类具体聚集在良性癌肿血细胞核膜中,hdWGCNA介绍设别出9个DNA模块图片(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的生存游戏下载游戏下载介绍确实YBX1为自立生存游戏下载游戏下载危害性环境因素(图1H)。进步骤切合IHC、WB实验英文和良性癌肿组识与紧邻非良性癌肿组识的区域转录组学数据资料源集得知YBX1是肝血细胞核膜癌制疗的意向靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被决定为缓解HCC生殖细胞糖酵解的重点情况
02、YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能量是什么代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1构建并增进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1联系并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷过酸,可以推进其核转位
进几步检侧YBX1的O-GlcNAc糖基化能不导致其磷过酸,在OGT敲低的HCC人体体细胞中或用OGT促使剂OSMI-1治理 ,YBX1蛋清质情况为有效性缩减,YBX1磷过酸为有效性缩短(图4A-C)。IP检测现示,在是一样的的Flag-YBX1底物情况下,YBX1-WT的磷过酸情况为有效性少于YBX1-T57A,反映磷过酸的扩大不只仅是而且更高些的YBX1蛋清质把你想表达出来方法(图4D)。分离出来了核和质混合物感觉TMG治理 的HCC人体体细胞中YBX1核把你想表达出来方法的提高(图4E-F),进几步感觉YBX1磷过酸的核心设定指数公式是AKT(图4G-I)。这类感觉透露O-GlcNAc糖基化进行催进其磷过酸来增强学习YBX1蛋清质不稳定度处理性并催进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰有效于其进的一步情况磷酸性反应装饰并就能够有利于其核转位
05、YBX1促使PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 会提供组核蛋白乳过酸突显平均水平
的研究察觉YBX1敲低差异性减低蛋清质乳酸性反应,通常是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解控注射剂2-DG的实验室查证了糖酵解与组蛋清乳酸性反应的直观联系,控制糖酵解可差异性减低H3K18la含量(图6D)。PKM2过表明可逆转转YBX1敲低所导致的的H3K18la越来越低,之外源乳酸净化处理不仅仅大幅提升H3K18la,还引发YBX1表明调整,温馨提示存在着正面返馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la顺利通过含有于YBX1进行子直观强化其转录,该全过程受O-GlcNAc糖基化调节作用(图6H-J),并察觉P300 调整是YBX1强化H3K18乳酰凝成用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1增强学习H3K18乳过酸突显水平面
软文工作小结
在一种研究探讨中新闻报道了YBX1在HCC中高展现,和与糖酵破译切重要性。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,因而稳固蛋清质并增高其展现。一种淡化还推动YBX1在T57处的磷酸性反应,推动其核易位。因为,此期间减弱了糖酵解重要性DNA的转录并敏感乳酸的出现。然而,YBX1激发P300的转录,而使动力组蛋清的乳酸性反应,十分是H3K18la,H3K18乳酸性反应双向调空YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性双面馈环机制化图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点能源代谢率组技术服务,拜谱生物技术建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、英译后表达组学、产生组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考生期刊论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.