代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
基本组成营养成份评定：消化吸收转化组学技術就都能够对中药才配方中的耐腐蚀基本组成营养成份参与多方面剖析，评定出中药才中的可溶性基本组成营养成份。列如，凭借鉴于质谱（MS）的消化吸收转化组学技術，都能够评定出红参中的红参皂苷等可溶性基本组成营养成份。这样技術还都能够分别中药才和非中药才环节的耐腐蚀符号物，为中药才配方的质量水平抑制具备重要依据。
的线质理把握：使用消化吸收组学技能，能能对中西药的的线质理开展评估报告和把握。这类，灵活运用花草消化吸收组学数据分析，能能开发管理针对性类痛风性环节炎的中西药含量的的线质理标注的降钙素原检测策略。因此，消化吸收组学还能能分辨中西药中的毒副作用含量试述毒副作用缘由，如使用UPLC-Q-TOF-MS探析，分清不同的乌头花草的耐腐蚀含量，并分辨极具镇痛药抗逆性和猛然毒副作用的生态学碱。
2. 中药药效机制研究
帮住靶点辨别：代谢率组学枝术可帮住辨别中西药化学活化基本成分的团伙靶点。举例，理论研究遇到雷公藤红素可进行控制Treg/TH1和Treg/Th17均衡性、中医NF-κB径路等工作机制起免疫抑制帮住。
帮助体制加以分享：细胞产生组学新技术才能够阐述中成药缓解妇科疾病的帮助体制。举例子，科研发现了青蒿素抗药与疟原虫的线粒体细胞产生更改关于，非靶向治疗细胞产生组学阐述了与该过程中 有关系的细胞产生物转化。不但，细胞产生组学还能够进行分享细胞产生物的转化，科研中成药复方的帮助体制。
3. 中药安全性评价
致癌性逻辑阐述：排泄组学技术应用会在阐述西药的致癌性逻辑。举个例子，顺利通过排泄组学和16S rDNA测序的优势互补阐述，折射出了清益汤对病情比较重的时候突然胰腺炎一些突然肺挫伤的确保逻辑，并敲定了铁沉积、相互影响排泄物和微生物培养基工程菌群两者之间的相互关系。
稳定卫生性分析风险评估：分解代谢组学技木还可能在中草药的稳定卫生性分析风险评估，甄别自身的致癌性组成和致癌性靶点，关键在于为中草药的稳定卫生运用供给物理学合理性。
4. 中医证候研究
证候有关的分解物阐述：分解组学技术水平能够 适用于定性分析与中醫证候有关的的内源性分解物转变，辅助性中醫证候的诊断仪和矫治。举列，使用分解组学钻研，已在冠烦扰之处患儿中签别出与痰瘀证和气流阴两虚证有关的的生态学标签物。
证候调查分享：分泌率组学技术应用应用还可能代替分享中要对中医药证候的调查作用。诸如，利用分泌率组学技术应用应用及聚类算法分享法，发现“黄芪-茯苓-泽泻”等关联性类制剂加配适代替肾病结合征的新组方类制剂，够对不同肾病结合征相应的动物象征物制造不良影响。
5. 多组学技术整合应用
几组学整理：代谢转化组学与某个组学技术水平（如什么是基因组学、转录组学、球营养杂质组学等）的整理APP，为西药材研究概述给出好几个个多纬度的概述架构图。这一整理APP不单单渐渐地普及和加深了我们都对西药材材质在分子式本质上对人体健康顺利和方面的问题的情形的损害，所以为体现了西药材的使用系统和药力杂质基础理论给出了强力量的工貝。
慢性病医疗逻辑：几组学新技术也可以中用论述成药医疗慢性病的氧分子逻辑。如，确认球营养素组学和分解基础代谢组学的联和应运，探求了与中国传统医学各类的膝骨节骨性骨节炎关系密切关于的不一致性表达爱球蛋清和分解基础代谢环路。
产生组学能力在草药调查中的广泛应用，为草药的当今化和精准脱贫医疗机构出示了极为重要的地理学鼓励，能够促进推向草药的原则化和展览化发展趋势。