
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探究結果
论述的人员来探寻由于冷冻冷藏库时候延后鸡肉的硬性标准、持水、光亮、悬浮铁分量、ROS、脂质过被化合物、MDA、GSH和GPX4的水平来分析评估全身肌肉组织化生殖细胞膜的铁生亡壮态。最终结果显视,冷冻冷藏库时候延后后,鸡肉的硬性标准在第5天和第6天同质性变低;持水作用影响;色泽变深,流失光亮,鲜红改为暗红。还有,悬浮铁、活力性氧和MDA的分量同质性加强,生殖细胞膜凋亡率同质性增加。 研发职工获取有所异同冰箱准确时间的健身身体肌肉打样定制的球膳食纤维,那么开展SDS-PAGE分折一下,球膳食纤维条带在有所异同时间地域分布平均且相像(图1a)。依据球营养物质在有所异同打样定制中的表现环境,分折一下知道同种条组打样定制的中个数更加接近于同种条含量(图1b),表明健身身体肌肉打样定制球膳食纤维极具良好的的组内相像性和组间异同性。 核蛋清组学共认定费出1996种核蛋清。以B0为剖析组,挑选B1、B2、B4和B6中的核蛋清实行差别的形容分享,共认定费到376个DEPs。将火山图可视化数据,并通过FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个规定分享DEP。结局如下图1c-f随时,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别认定费出22、33、73和140个DEPs,之中分头别调整6、11、32和83个,变动16、22、41和51个。聚类分析法的方法鉴定了的不同冷库价段健身背部肌肉组织开展中核蛋清的形容,结局现示健身背部肌肉核蛋清形容差别的逐渐贮存周期的不断增高而不断增高(图1g)。
图1| 有差异冷藏库日期的力量原辅料球营养物质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各不相同冷藏箱时间段的肌检样差距球蛋白讲解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死亡者血清肽的PRM按量探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 立于KEGG含有区别表示球蛋白的铁牺牲制度化(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT降钙素原检测蛋清质组学技术水平设备精准服務,拜谱生物制品已生产制造成功完成并形成了全面比较成熟的转录组学、蛋清组学、分解组学或者多个学联动成品技术水平设备精准服務模式,欢迎致电咨询!
基准期刊论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.